Die DSO hat sieben Regionen in Deutschland gebildet. Der Sitz der Hauptverwaltung und des Vorstandes ist Frankfurt am Main. Der Stiftungsrat ist das Aufsichtsgremium der DSO. Er bestellt den Vorstand und überwacht dessen Tätigkeit.
Der Stiftungsrat ist das Aufsichtsgremium der DSO. Er bestellt den Vorstand und überwacht dessen Tätigkeit.
Der Vorstand zeichnet für die gerichtliche und außergerichtliche Vertretung der Stiftung verantwortlich und ist Disziplinarvorgesetzter aller Mitarbeiter der DSO.
Die Arbeit der DSO wird durch einen verpflichtenden Bundesfachbeirat unterstützt, der die systematisierte Beratung der DSO in fachmedizinischen und wissenschaftlichen Fragen übernimmt.
Jede Region wird von einem Fachbeirat beraten. Dieser setzt sich zusammen aus Vertretern der regionalen Transplantationszentren, der Landesärztekammern, der gesetzlichen Krankenversicherer und der Krankenhäuser.